Mengawali babak kedua, pelatih kedua tim tidak melakukan perubahan pemain. Australia dengan sabar membongkar pertahanan Indonesia. Bahkan Mohamed Toure yang dalam posisi bebas. Namun eksekusinya berhasil dimentahkan Ernando Ari.
Babak kedua memasuki 15 menit. Australia terus menekan, tapi belum berhasil. Pelatih Tony Vidmar kemudian menarik Keegan Jelacic dan Adrian Segecic keluar dan mengganti dengan Lachlan dan Jordi Valadon,
Dibabak kedua ini, Timnas Indonesia nyaris terkepung. Apalagi pihak Australia sering melakukan tekel pada lawan. Timnas Indonesia juga dihantui keletihan.
Untuk keluar dari tekanan, pelatih Shin Tae-yong, memasukkan Justin Hubner dengan menarik keluar Jeam Sroyer .
Mohamed Toure kembali membuang peluang. Vidmar melakukan pergantian pemain. Mohamed Toure, Nishan Velupillay, dan Jake Hollman digantikan Alou Kuol, Nicolas Milanovic, dan Garang Kuol.
Indonesia merespon. Rio Fahmi menggantikan Fajar Fathur Rahman. Tidak lama berselang, Komang Teguh gagal menyelesaikan laga karena cedera.
Ikhsan Zikrak masuk mengisi posisinya.
Ernando Ari kembali beraksi. Usai menghentikan umpan silang Australia, dia memblok tendangan Lachlan Brook.
Wasit memberi tambahan waktu 11 menit. Indonesia mendapat kesempatan langka. Penetrasi Nathan Tjoe-A-On berbuah peluang bagi Marselino Ferdinan. Sayang usahanya diblok lawan.